Forwarded from Бiоинформатика и лапки
Западный научпоп ничем не лучше нашего, отака хуйня, малята.
Прибираюсь под видосик одной уважаемой в моей референтной группе научпоперши-физика, Анжелы Колье. Видос про сферы Дайсона.
Начала довольно неплохо, но где-то на 18 минуте пошли охуительные истории про Томаса Мальтуса. "I don't know if there is any evidence for exponential growth of the population", "he's a known eugenicist who listened to one lecture on geometry and invented dumb shit", "great replacement theory is racist, racism is bad". Сука, ору...
Эвиденсов про экспоненту роста дохуя и больше, лолка. То, что она не экспонента, а ограничена сверху обьемом ресурсов (то есть становится логистической при исчерпании запаса), было известно еще примерно во времена Мальтуса, для описания роста популяции в свое время Ферхлюст и Кетле ее и придумали. Мальтузианская модель же верна в краткой перспективе, и это неоднократно наблюдается в том же самом росте бактериальных колоний.
Классическая ошибка научпопперса нумер один -- лезть не в свою область с апломбом супергения, считая всех специалистов в ней дебилами.
Классическая ошибка научпопперса нумер два -- смотреть на неприятные тебе идеи со своей колокольни политических взглядов средней вестоидной белой бабы старше тридцати.
Нет пророка в чужом отечестве, ага. Тьфу, бля.
Прибираюсь под видосик одной уважаемой в моей референтной группе научпоперши-физика, Анжелы Колье. Видос про сферы Дайсона.
Начала довольно неплохо, но где-то на 18 минуте пошли охуительные истории про Томаса Мальтуса. "I don't know if there is any evidence for exponential growth of the population", "he's a known eugenicist who listened to one lecture on geometry and invented dumb shit", "great replacement theory is racist, racism is bad". Сука, ору...
Эвиденсов про экспоненту роста дохуя и больше, лолка. То, что она не экспонента, а ограничена сверху обьемом ресурсов (то есть становится логистической при исчерпании запаса), было известно еще примерно во времена Мальтуса, для описания роста популяции в свое время Ферхлюст и Кетле ее и придумали. Мальтузианская модель же верна в краткой перспективе, и это неоднократно наблюдается в том же самом росте бактериальных колоний.
Классическая ошибка научпопперса нумер один -- лезть не в свою область с апломбом супергения, считая всех специалистов в ней дебилами.
Классическая ошибка научпопперса нумер два -- смотреть на неприятные тебе идеи со своей колокольни политических взглядов средней вестоидной белой бабы старше тридцати.
Нет пророка в чужом отечестве, ага. Тьфу, бля.
YouTube
dyson spheres are a joke
I found pdfs of a bunch of these papers so I will just link there:
Original Dyson paper:
https://epizodsspace.airbase.ru/bibl/inostr-yazyki/science/1960/Dyson_Search_for_Artificial_Stellar_Sources_of_Infrared_Radiation_Science_131_(1960).pdf
Cited Nature…
Original Dyson paper:
https://epizodsspace.airbase.ru/bibl/inostr-yazyki/science/1960/Dyson_Search_for_Artificial_Stellar_Sources_of_Infrared_Radiation_Science_131_(1960).pdf
Cited Nature…
👍7⚡1
Forwarded from Ряды Фурье
Очень крутая работа сегодня от участника нашего сообщества. @science_boy картографировал мышь антителами. Его канал — @chelovek_nauk
Не просто кости и органы, а на уровне отдельных клеток: где находится каждый нейрон, каждая иммунная клетка, каждый кровеносный и лимфатический сосуд.
Раньше мышь морозили и делали томографию. Не компьютерную, обычную, то есть резали мышь на 1-пиксельные слои и каждый фотографировали под микроскопом. Пиксель должен быть меньше клетки, но такой, чтобы ещё можно было отрезать имеющимися инструментами.
Тут в лаборатории предложили сделать прозрачную мышь и покрасить нужные клетки внутри, а затем изучить всё это в 3D, не разрезая.
Первая проблема в том, что мыши обычно непрозрачные. Но это только кажется проблемой, настоящие учёные считают такие вещи мелочами.
Вторая проблема — разметка интересующих клеток. Для этого используют антитела — белки, которые умеют прилипать к конкретным молекулам на поверхности клеток. К этим антителам приваривают светящуюся метку.
Сложно заставить антитела пройти глубоко внутрь плотных тканей. IgG довольно крупные, и они просто застревали на поверхности. Опять же, раньше надо было либо делать инженерные нано-антитела, либо делать генмодифицированных мышей, у которых разные органы окрашивались люциферазой. Кстати, до сих пор никто не мешает сделать мышь со светящимися красными глазами и завести в качестве домашнего питомца-фонарика. Кроме этического комитета, конечно.
Но тут сделали вот что:
— Холестерин делает мембраны клеток плотными.
— Бета-циклодекстрин умеет забирать холестерин из мембран и делать в них дырки.
— Это открывает путь для крупных стандартных антител IgG.
— Мышь безболезненно убивают, отмывают от крови и фиксируют ткани.
— Через кровеносную систему прокачивается раствор с антителами и β-циклодекстрином.
— Антитела теперь могут свободно проходить во все ткани — мозг, сердце, мышцы, кости.
— Мышь уезжает на проявку, где ткани становятся прозрачными, это несколько дней.
— Тело жертвы науки сканируют с помощью светолистового микроскопа. Он просвечивает образец тонкими слоями лазера и создает из тысяч таких срезов единое трехмерное изображение.
— Получается большой объем данных.
Создали онлайн-атлас, куда выложили эти 3D-карты, чтобы другие исследователи могли их изучать.
Вот тут его можно полистать и проникнуться.
Так что теперь из мыши можно сделать карту для CS2 или подземелье для Морровинда.
— А так ещё полностью картировали периферическую нервную систему, показав, как нервы проникают во все ткани, включая жировую ткань и позвонки. Смогли проследить путь блуждающего нерва к печени, селезенке и кишечнику.
— Создали первую полную 3D-карту всех лимфатических сосудов. Обнаружили лимфатические сосуды, входящие непосредственно в ткань мозга (паренхиму). Раньше думали, что в самой ткани мозга их нет.
— Нанесли на карту расположение иммунных клеток по всему телу. Увидели, что иммунные клетки (CD45) скапливаются вдоль нервных волокон, особенно в кишечнике. Это доказательство, что нервная и иммунная системы обмениваются данными.
— Сравнили обычных мышей и стерильных мышей, у которых нет микробов в кишечнике. Оказалось, что у стерильных мышей нервная сеть в стенке кишечника (миэнтериальное сплетение) была гораздо менее плотной и дезорганизованной.
Теперь ученые по всему миру могут использовать тысячи уже существующих, стандартных и дешевых IgG-антител для изучения своих белков в контексте целого организма. Не нужно тратить годы на создание ГМО-животных.
Ну и метод позволяет изучать системные заболевания, которые затрагивают сразу несколько органов (аутоиммунные болезни, рак с метастазами, нейродегенеративные расстройства).
Короче, это невероятно круто.
Вот у него в канале другие (не его лично) издевательства над мышами, тут в мышь поставили порт для микроскопа.
--
Вступайте в ряды Фурье!Вирус — это РНК в косухе
Не просто кости и органы, а на уровне отдельных клеток: где находится каждый нейрон, каждая иммунная клетка, каждый кровеносный и лимфатический сосуд.
Раньше мышь морозили и делали томографию. Не компьютерную, обычную, то есть резали мышь на 1-пиксельные слои и каждый фотографировали под микроскопом. Пиксель должен быть меньше клетки, но такой, чтобы ещё можно было отрезать имеющимися инструментами.
Тут в лаборатории предложили сделать прозрачную мышь и покрасить нужные клетки внутри, а затем изучить всё это в 3D, не разрезая.
Первая проблема в том, что мыши обычно непрозрачные. Но это только кажется проблемой, настоящие учёные считают такие вещи мелочами.
Вторая проблема — разметка интересующих клеток. Для этого используют антитела — белки, которые умеют прилипать к конкретным молекулам на поверхности клеток. К этим антителам приваривают светящуюся метку.
Сложно заставить антитела пройти глубоко внутрь плотных тканей. IgG довольно крупные, и они просто застревали на поверхности. Опять же, раньше надо было либо делать инженерные нано-антитела, либо делать генмодифицированных мышей, у которых разные органы окрашивались люциферазой. Кстати, до сих пор никто не мешает сделать мышь со светящимися красными глазами и завести в качестве домашнего питомца-фонарика. Кроме этического комитета, конечно.
Но тут сделали вот что:
— Холестерин делает мембраны клеток плотными.
— Бета-циклодекстрин умеет забирать холестерин из мембран и делать в них дырки.
— Это открывает путь для крупных стандартных антител IgG.
— Мышь безболезненно убивают, отмывают от крови и фиксируют ткани.
— Через кровеносную систему прокачивается раствор с антителами и β-циклодекстрином.
— Антитела теперь могут свободно проходить во все ткани — мозг, сердце, мышцы, кости.
— Мышь уезжает на проявку, где ткани становятся прозрачными, это несколько дней.
— Тело жертвы науки сканируют с помощью светолистового микроскопа. Он просвечивает образец тонкими слоями лазера и создает из тысяч таких срезов единое трехмерное изображение.
— Получается большой объем данных.
Создали онлайн-атлас, куда выложили эти 3D-карты, чтобы другие исследователи могли их изучать.
Вот тут его можно полистать и проникнуться.
Так что теперь из мыши можно сделать карту для CS2 или подземелье для Морровинда.
— А так ещё полностью картировали периферическую нервную систему, показав, как нервы проникают во все ткани, включая жировую ткань и позвонки. Смогли проследить путь блуждающего нерва к печени, селезенке и кишечнику.
— Создали первую полную 3D-карту всех лимфатических сосудов. Обнаружили лимфатические сосуды, входящие непосредственно в ткань мозга (паренхиму). Раньше думали, что в самой ткани мозга их нет.
— Нанесли на карту расположение иммунных клеток по всему телу. Увидели, что иммунные клетки (CD45) скапливаются вдоль нервных волокон, особенно в кишечнике. Это доказательство, что нервная и иммунная системы обмениваются данными.
— Сравнили обычных мышей и стерильных мышей, у которых нет микробов в кишечнике. Оказалось, что у стерильных мышей нервная сеть в стенке кишечника (миэнтериальное сплетение) была гораздо менее плотной и дезорганизованной.
Теперь ученые по всему миру могут использовать тысячи уже существующих, стандартных и дешевых IgG-антител для изучения своих белков в контексте целого организма. Не нужно тратить годы на создание ГМО-животных.
Ну и метод позволяет изучать системные заболевания, которые затрагивают сразу несколько органов (аутоиммунные болезни, рак с метастазами, нейродегенеративные расстройства).
Короче, это невероятно круто.
Вот у него в канале другие (не его лично) издевательства над мышами, тут в мышь поставили порт для микроскопа.
--
Вступайте в ряды Фурье!
🔥23❤2
Forwarded from Зоопарк из слоновой кости
#помощь_зала
Те, кто нас читают давно, знают, что Смотрители крайне редко обращаются к нашим посетителям с призывом помочь кому-нибудь трудовым рублем. Но на то они и исключения, чтоб иногда случаться.
На днях в Новосибирском зоопарке (который по праву считается одним из лучших в стране) случилась беда - пожар, несколько животных погибло, ещё несколько пострадало, повреждены вольеры. Ликвидация последствий - тех, что можно устранить - конечно, влетит в копеечку.
Поскольку мы всё-таки тоже Зоопарк, мы хотим поддержать хороших людей и зверей. Кто хочет присоединиться - кнопка для донейтов есть прямо на официальном сайте.
https://zoonovosib.ru/
Те, кто нас читают давно, знают, что Смотрители крайне редко обращаются к нашим посетителям с призывом помочь кому-нибудь трудовым рублем. Но на то они и исключения, чтоб иногда случаться.
На днях в Новосибирском зоопарке (который по праву считается одним из лучших в стране) случилась беда - пожар, несколько животных погибло, ещё несколько пострадало, повреждены вольеры. Ликвидация последствий - тех, что можно устранить - конечно, влетит в копеечку.
Поскольку мы всё-таки тоже Зоопарк, мы хотим поддержать хороших людей и зверей. Кто хочет присоединиться - кнопка для донейтов есть прямо на официальном сайте.
https://zoonovosib.ru/
Forwarded from Духи наизнанку | Кирилл Хайкин
Как заставить продукты жизнедеятельности пахнуть грушей и бананом?
Легко! Ещё в 2006 году биологи из MIT нашли ответ. Они провели эксперимент на бактериях кишечной палочки E. coli, а проект назвали по-парфюмерному — Eau d’coli.
Дело в том, что в процессе жизнедеятельности обычные E. coli выделяют индол — соединение, запах которого ассоциируется с фекалиями или тухлой капустой.
Чтобы избавиться от неприятного запаха, команда использовала штамм бактерий с мутацией в гене tnaA, который отвечает за синтез индола — такие бактерии не способны производить индол. Это создало «чистый холст» для дальнейшей работы.
Затем в ДНК бактерии встроили ген ATF1, позаимствованный у пекарских дрожжей. Этот ген кодирует фермент алкоголь-ацилтрансферазу, который, в свою очередь, катализирует реакцию этерификации: превращает спирты в сложные эфиры, которые часто обладают фруктовыми ароматами. Если добавить в среду изоамиловый спирт, модифицированные E. coli преобразуют его в изоамилацетат — соединение с ярким ароматом банана и груши.
Возможно, в будущем подобные модификации удастся применить и к бактериям в пищеварительной системе человека. И тогда фраза «девочки едят бабочек икакают цветочками» обретёт новый, научный смысл…
Ссылка на статью. Подсмотрел тут.
#экспертнаизнанку
Легко! Ещё в 2006 году биологи из MIT нашли ответ. Они провели эксперимент на бактериях кишечной палочки E. coli, а проект назвали по-парфюмерному — Eau d’coli.
Дело в том, что в процессе жизнедеятельности обычные E. coli выделяют индол — соединение, запах которого ассоциируется с фекалиями или тухлой капустой.
Чтобы избавиться от неприятного запаха, команда использовала штамм бактерий с мутацией в гене tnaA, который отвечает за синтез индола — такие бактерии не способны производить индол. Это создало «чистый холст» для дальнейшей работы.
Затем в ДНК бактерии встроили ген ATF1, позаимствованный у пекарских дрожжей. Этот ген кодирует фермент алкоголь-ацилтрансферазу, который, в свою очередь, катализирует реакцию этерификации: превращает спирты в сложные эфиры, которые часто обладают фруктовыми ароматами. Если добавить в среду изоамиловый спирт, модифицированные E. coli преобразуют его в изоамилацетат — соединение с ярким ароматом банана и груши.
Возможно, в будущем подобные модификации удастся применить и к бактериям в пищеварительной системе человека. И тогда фраза «девочки едят бабочек и
Ссылка на статью. Подсмотрел тут.
#экспертнаизнанку
❤16🔥6🤯4💊2👍1
Forwarded from Зоопарк из слоновой кости
#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция
Интересное о мозгах - вернее, о том, что с ними происходит после кончины из обладателя. Анализ липидного и метаболического профиля ткани мозга - один из ключевых подходов в нейронауках, по этим данным можно узнать очень и очень многое.
Проблема тут в том, что мозг до смерти и после - это с химической точки зрения совсем не одно и то же. Решить обратную задачу, то есть понять, что было при жизни, можно, но это вовсе не так просто. Предыдущие исследования таких изменений были сосредоточены либо на модельных организмах (грызунах), либо не на липидах, что не давало полной картины для исследований.
Чтобы восполнить этот пробел, команда исследователей из Сколтеха совместно с коллегами из Сеченовки оценила скорость посмертной деградации липидов и метаболитов. Параллельные эксперименты были проведены на образцах ткани мозга человека, крыс и мышей. С помощью высокоточной масс-спектрометрии ученые отслеживали динамику более 870 липидов и 100 полярных метаболитов в течение 48 часов после смерти.
Оказалось, что 673 липида и 24 полярных метаболита сохраняют стабильность в течение 48 часов после смерти, что подтверждает надежность исследований с этими молекулами. Для остальных 201 липида и 80 метаболитов были установлены точные траектории деградации или накопления. При этом в мозге человека посмертные изменения протекают значительно медленнее, чем у грызунов, за исключением окисленных жирных кислот, которые быстро накапливаются у всех трех видов. Эти результаты позволяют гораздо точнее интерпретировать данные метаболомики посмертных образцов и закладывают основу для разработки методов коррекции посмертных изменений.
Результаты опубликованы в Biomolecules (IF=4.8) - и, кстати, работа поддержана РНФ
Интересное о мозгах - вернее, о том, что с ними происходит после кончины из обладателя. Анализ липидного и метаболического профиля ткани мозга - один из ключевых подходов в нейронауках, по этим данным можно узнать очень и очень многое.
Проблема тут в том, что мозг до смерти и после - это с химической точки зрения совсем не одно и то же. Решить обратную задачу, то есть понять, что было при жизни, можно, но это вовсе не так просто. Предыдущие исследования таких изменений были сосредоточены либо на модельных организмах (грызунах), либо не на липидах, что не давало полной картины для исследований.
Чтобы восполнить этот пробел, команда исследователей из Сколтеха совместно с коллегами из Сеченовки оценила скорость посмертной деградации липидов и метаболитов. Параллельные эксперименты были проведены на образцах ткани мозга человека, крыс и мышей. С помощью высокоточной масс-спектрометрии ученые отслеживали динамику более 870 липидов и 100 полярных метаболитов в течение 48 часов после смерти.
Оказалось, что 673 липида и 24 полярных метаболита сохраняют стабильность в течение 48 часов после смерти, что подтверждает надежность исследований с этими молекулами. Для остальных 201 липида и 80 метаболитов были установлены точные траектории деградации или накопления. При этом в мозге человека посмертные изменения протекают значительно медленнее, чем у грызунов, за исключением окисленных жирных кислот, которые быстро накапливаются у всех трех видов. Эти результаты позволяют гораздо точнее интерпретировать данные метаболомики посмертных образцов и закладывают основу для разработки методов коррекции посмертных изменений.
Результаты опубликованы в Biomolecules (IF=4.8) - и, кстати, работа поддержана РНФ
MDPI
Postmortem Stability Analysis of Lipids and Polar Metabolites in Human, Rat, and Mouse Brains
Lipids and polar metabolites are emerging as promising indicators of the brain’s molecular phenotype in both clinical and fundamental research. However, the impact of postmortem delay on these compounds, unavoidable in human brain studies, remains insufficiently…
🔥8❤1
Forwarded from Cancer 3D
Новый набор в Cancer 3D
В нашем проекте мы изучаем развитие опухолей в разных тканях с помощью микро-КТ изображений и гистологических срезов. Наша цель – создать точные модели инвазии опухоли и вовлечь всех желающих в разметку патологических областей.
Мы подготовили три зоны для анализа инвазии: Liver Fingers – опухоль в печени с пальцевидными выростами, Pancreas Invasion – опухоль в поджелудочной железе, и Muscle Invasion – инвазия в мышечную ткань рядом с поджелудочной. Уже почти сегментирована треть сканов для Pancreas Cancer, и мы продолжаем активно двигаться к цели проекта.
Разметка этих зон позволяет изучать, как опухоль проникает в ткани, выделять структуры органов и вторгающиеся клетки, исследовать геометрию отростков и взаимодействие с соединительной тканью. Мы приглашаем всех желающих присоединиться! Отправляйте заявку, мы добавим в чат и все расскажем. Старые заявки в рамках нового набора также будут рассмотрены в ближайшее время.
Подать заявку
White paper проекта
В нашем проекте мы изучаем развитие опухолей в разных тканях с помощью микро-КТ изображений и гистологических срезов. Наша цель – создать точные модели инвазии опухоли и вовлечь всех желающих в разметку патологических областей.
Мы подготовили три зоны для анализа инвазии: Liver Fingers – опухоль в печени с пальцевидными выростами, Pancreas Invasion – опухоль в поджелудочной железе, и Muscle Invasion – инвазия в мышечную ткань рядом с поджелудочной. Уже почти сегментирована треть сканов для Pancreas Cancer, и мы продолжаем активно двигаться к цели проекта.
Разметка этих зон позволяет изучать, как опухоль проникает в ткани, выделять структуры органов и вторгающиеся клетки, исследовать геометрию отростков и взаимодействие с соединительной тканью. Мы приглашаем всех желающих присоединиться! Отправляйте заявку, мы добавим в чат и все расскажем. Старые заявки в рамках нового набора также будут рассмотрены в ближайшее время.
Подать заявку
White paper проекта
Forwarded from альтер эго zдесь🇷🇺☦ (alteregotutpost)
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
❤9🥰3🤔3😱3💊2👍1
Forwarded from Роскосмос
Первый искусственный спутник Земли вывели на орбиту 4 октября 1957 года, там он провёл 92 дня
▶️ За это время аппарат совершил 1440 витков вокруг нашей планеты.
Запуск первого спутника Земли и его полёт получили ошеломляющий мировой резонанс.
🔴 Спустя 10 лет в ознаменование этого события 4 октября провозгласили Днём начала Космической эры человечества.
#ЦифраНедели — рубрика, в которой мы знакомим вас с важными цифрами ракетно-космической отрасли.
❤️ Роскосмос | Подписаться
Запуск первого спутника Земли и его полёт получили ошеломляющий мировой резонанс.
#ЦифраНедели — рубрика, в которой мы знакомим вас с важными цифрами ракетно-космической отрасли.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥9
Forwarded from Сфероиды и ствижженое
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#microscopy
Коллеги, собираю красивые видяшечки процесса нетоза, для презентации студентам. Если у кого есть поделитесь пожалуйста?
Мечта - трехмерная видяшка где видно и имунные клетки и микроорганизмы. Вот такую и ещё одну в комментах принесли, но может ещё что есть.
Коллеги, собираю красивые видяшечки процесса нетоза, для презентации студентам. Если у кого есть поделитесь пожалуйста?
Мечта - трехмерная видяшка где видно и имунные клетки и микроорганизмы. Вот такую и ещё одну в комментах принесли, но может ещё что есть.
❤4