Агенты ИИ | AGI_and_RL

Биологические на месте?
Там ребята выложили опенсурсную биомодельку Boltz-2

Т.к. я не шарю, то спросил у чатгпт по статейке что же делает:

Boltz-2 — это «универсальный движок» именно для задач структурной биологии и дизайна лекарств

Что делает?

- Строит форму белка, РНК/ДНК и лигандов в одном комплексе.
- Сразу оценивает силу связывания (Ki/Kd/IC50-подобную) — т.е. подсказывает, какая молекула будет держаться крепче.
- Всё это за ~20 с на одной видеокарте, тогда как классический FEP тратит часы-дни. 

Чем полезен на практике?
- Быстрый фильтр миллионов соединений в виртуальном скрининге.
- Точная ранжировка близких аналогов на стадии hit-to-lead.
- Генерация новых молекул вместе с GFlowNet — модель сама предлагает, что синтезировать.

Boltz-2 — мощный, быстрый и открытый инструмент именно для 3-D структур и связывания

В целом Boltz-2 это альтернатива AlphaFold 3.
но веса у AF3 закрыты и надо просить по запросу к Гуглу-Дипмаинду.
А у Больтза все открытое.

Можно хорошо почитать тут
https://rowansci.com/blog/boltz2-faq

И к ней уже GUI прикрутили с инструкцией по запуску тут: https://proteinlanguagemodel.com/blog/how_to_run_boltz2_locally


Boltz-2: Towards Accurate and Efficient Binding Affinity Prediction
https://cdn.prod.website-files.com/68404fd075dba49e58331ad9/6842ee1285b9af247ac5a122_boltz2.pdf

пост
https://boltz.bio/boltz2

код для запуска
https://github.com/jwohlwend/boltz

моделька
https://huggingface.co/boltz-community/boltz-2

PS собираем ИИнформацию и проекты делаем в https://www.group-telegram.com/researchim

1🔥16❤2👍1

www.group-telegram.com/us/AGI_and_RL.com/1140

17.7K viewsedited  Jun 12 at 14:46

Биологические на месте?
Там ребята выложили опенсурсную биомодельку Boltz-2

Т.к. я не шарю, то спросил у чатгпт по статейке что же делает:

Boltz-2 — это «универсальный движок» именно для задач структурной биологии и дизайна лекарств

Что делает?

- Строит форму белка, РНК/ДНК и лигандов в одном комплексе.
- Сразу оценивает силу связывания (Ki/Kd/IC50-подобную) — т.е. подсказывает, какая молекула будет держаться крепче.
- Всё это за ~20 с на одной видеокарте, тогда как классический FEP тратит часы-дни. 

Чем полезен на практике?
- Быстрый фильтр миллионов соединений в виртуальном скрининге.
- Точная ранжировка близких аналогов на стадии hit-to-lead.
- Генерация новых молекул вместе с GFlowNet — модель сама предлагает, что синтезировать.

Boltz-2 — мощный, быстрый и открытый инструмент именно для 3-D структур и связывания

BY Агенты ИИ | AGI_and_RL