group-telegram.com/UIBiologists/10308
Last Update:
✨ شبیه‌سازی دینامیک آنزیم‌ها و ابررایانه (Gefion)
📊 شبیه‌سازی دینامیک آنزیم‌ها یکی از ابزارهای کلیدی در بیوانفورماتیک و شیمی محاسباتی است که به ما کمک می‌کند تا رفتار و عملکرد آنزیم‌ها را در شرایط مختلف بررسی کنیم.
💻 برای شبیه‌سازی آنزیم، ابتدا ساختار سه‌بعدی آن با استفاده از داده‌های تجربی (کریستالوگرافی اشعه ایکس یا NMR) یا مدل‌سازی محاسباتی ایجاد می‌شود. سپس شرایط محیطی مانند pH، دما و غلظت مواد اولیه تعیین می‌شود. در مرحله بعد، با استفاده از نرم‌افزارهای شبیه‌سازی مانند GROMACS، AMBER یا CHARMM، دینامیک مولکولی آنزیم شبیه‌سازی می‌شود که شامل محاسبه نیروهای بین اتم‌ها و پیش‌بینی حرکات آن‌ها است.
💡 نتایج حاصل از شبیه‌سازی شامل تغییرات ساختاری، انرژی‌های پتانسیل و تعاملات میان آنزیم و سوبسترا مورد تحلیل قرار می‌گیرند. با بررسی این تغییرات در انرژی و ساختار، می‌توان فعالیت آنزیم و مکانیزم عملکرد آن را پیش‌بینی کرد.
🟠 این روش‌ها به پژوهشگران این امکان را می‌دهند که درک بهتری از مکانیزم‌های بیوشیمیایی پیدا کنند و طراحی داروهای هدفمند را تسهیل نمایند.
یاسمن واثقیان✍🏼
┏━━━━━━
🆔 @UIBiologists🌱💡
┗━━━━━━
BY کانال اتحاد زیست‌شناسان ایران
Share with your friend now:
group-telegram.com/UIBiologists/10308